Dzięki wierszowi poleceń można stoczyć szybką walkę z komputerem, przetestować postać lub arenę, itd. Przykładowo żeby Mugen po uruchomieniu automatycznie zaczynał walkę pomiędzy postaciami Kung Fu Man (kfm) i Suave dude (suave), komenda powinna wyglądać następująco:

mugen.exe kfm suave

Żeby stoczyć tą samą walkę na arenie stage0.def wystarczy dodać parametr -s i nazwę pliku DEF areny:

mugen.exe kfm suave -s stage0

Natomiast ten przykład uruchomi walkę trzech Kung Fu Manów P1+P3 vs P2 z różnymi parametrami na arenie stage0-720.def:

mugen.exe -p1.color 2 kfm -p2.color 4 kfm -p3.ai 8 kfm -s stage0-720