Najnowsza wersja silnika to Mugen 1.1 na platformę Windows, wersje na Dosa i Linuxa nie są już wspierane. Stare wersje silnika obsługują tylko niskie rozdzielczości, nowe obsługują rozdzielczości do Full HD, które mogą współpracować niezależnie. Oznacza to że jedna postać może być stworzona w Low-Res, druga w Hi-Res a arena w High Definition i wszystko działa razem.

Rozdzielczości:
Low-Res - niska rozdzielczość: 320x240.
Hi-Res - wysoka rozdzielczość: 640x480.
HD - wysoka rozdzielczość High Definition: 1280x720.
Full HD - wysoka rozdzielczość Full High Definition: 1920x1080.

Dos Mugen

Platforma: DOS
Rozdzielczość: Low-Res
Opis: Najstarsza i nie wspierana już wersja silnika na platformę DOS.

Linux Mugen

Platforma: Linux
Rozdzielczość: Low-Res
Opis: Wersja silnika na platformę Linux, nie wspierana, ma te same możliwości co Win Mugen.

Win Mugen

Platforma: Windows
Rozdzielczość: Low-Res
Opis: Wersja silnika na platformę Windows, nie wspierana. Początkowo była dostępna tylko dla sponsorów projektu z limitami ilości aren i postaci, itd. Po wycieku wersji beta i zamknięciu projektu przez Elecbyte powstała wersja zhakowana No limit Win Mugen.

Win Mugen Plus

Platforma: Windows
Rozdzielczość: Low-Res, Hi-Res
Opis: Win Mugen Plus jest zmodyfikowaną wersją Win Mugena z udoskonaloną obsługą wyższej rozdzielczości czyli tzw. Hi-res. Twórcy Mugena pozostawiali w silniku różne zablokowane lub nie działające rzeczy, ludzie hackujący silnik część z nich aktywowali, stąd różne odmiany Win Mugena (Win Mugen Hi-Res Stages Only, Win Mugen Hi-Res Screenpack ) z których najlepszy jest Win Mugen Plus.

Mugen 1.0

Platforma: Windows
Rozdzielczość: Low-Res, Hi-Res, HD, Full HD
Opis: Pierwsza wersja nowego silnika Mugena (2011r.) na platformę Windows, opublikowana po tym jak firma Elecbyte powróciła ok. 2009 roku. Obsługuje wiele rozdzielczości jednocześnie, obsługuje kompatybilność wsteczną z Win Mugenem i Win Mugenem Plus.

Mugen 1.1

Platforma: Windows
Rozdzielczość: Low-Res, Hi-Res, HD, Full HD
Opis: Najnowsza wersja nowego silnika Mugena (2013r.) na platformę Windows, obsługuje wiele rozdzielczości jednocześnie, obsługuje kompatybilność wsteczną z Win Mugenem i Win Mugenem Plus, wprowadzono też oddalanie i przybliżanie kamery podczas gry.